近日,中國(guó)科學(xué)院華南植物園劉勛成團(tuán)隊(duì)在植物科學(xué)領(lǐng)域著名期刊Molecular Plant(《分子植物》)上發(fā)表了題為“HDT2-mediated lysine deacetylation promotes phytochrome A degradation during photomorphogenesis in Arabidopsis”的研究論文。該研究闡明:擬南芥遠(yuǎn)紅光受體——光敏色素phyA的穩(wěn)定性受乙?;揎梽?dòng)態(tài)調(diào)控,賴氨酸去乙酰化酶HDT2通過介導(dǎo)phyA去乙?;龠M(jìn)其泛素化與蛋白降解,從而精確調(diào)控遠(yuǎn)紅光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與幼苗光形態(tài)建成。該成果不僅深化了對(duì)光受體穩(wěn)定性調(diào)控機(jī)制的理解,同時(shí)揭示了非組蛋白乙酰化修飾在光形態(tài)建成中的關(guān)鍵作用。
1、研究背景
光敏色素phyA是植物中唯一特異性感知遠(yuǎn)紅光信號(hào)的受體蛋白。在暗生長(zhǎng)幼苗中phyA大量累積,而出土照光后迅速發(fā)生降解——該過程對(duì)于幼苗光信號(hào)傳遞與光形態(tài)建成至關(guān)重要。然而,phyA穩(wěn)定性如何被精確調(diào)控仍是未解之謎。賴氨酸(K)乙?;鳛檫M(jìn)化保守的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,既往研究多聚焦于組蛋白調(diào)控領(lǐng)域,非組蛋白(如光受體)乙?;揎椩诠庑螒B(tài)建成中的作用尚屬空白。
2、研究?jī)?nèi)容
(1)乙?;M學(xué)揭示幼苗從黑暗到照光過程中發(fā)生全局去乙?;录?/p>
研究團(tuán)隊(duì)通過Western blot實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),幼苗從黑暗轉(zhuǎn)入光照后,整體乙酰化水平顯著下降。進(jìn)一步利用乙酰化組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)鑒定該過程中發(fā)生修飾變化的蛋白及位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)光誘導(dǎo)了大量的蛋白和位點(diǎn)發(fā)生去乙?;hyA蛋白上存在4個(gè)保守的賴氨酸乙?;揎椢稽c(diǎn)(K65,K296,K536和K744),其中K65和K744位點(diǎn)發(fā)生顯著的去乙酰化(圖1)。
圖1. 乙?;M學(xué)分析發(fā)現(xiàn)phyA多個(gè)賴氨酸位點(diǎn)發(fā)生乙?;揎?/p>
(2)K65位點(diǎn)乙酰化影響phyA穩(wěn)定性、遠(yuǎn)紅光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及幼苗光形態(tài)建成
通過構(gòu)建位點(diǎn)特異模擬乙?;腿ヒ阴;霓D(zhuǎn)基因回補(bǔ)材料,研究人員證實(shí)僅K65位點(diǎn)的乙酰化狀態(tài)影響了phyA的生物學(xué)功能。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),該位點(diǎn)同時(shí)也是關(guān)鍵的泛素化修飾位點(diǎn),其突變顯著降低了phyA泛素化水平與降解速率,從而影響了下游轉(zhuǎn)錄因子HY5的水平與光響應(yīng)基因的表達(dá)。免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)表明,光照誘導(dǎo)的K65位點(diǎn)去乙?;?,直接促進(jìn)了phyA泛素化修飾,進(jìn)而被26S蛋白酶體途徑降解。以上研究首次揭示光誘導(dǎo)的phyA降解需經(jīng)歷“去乙酰化-泛素化”級(jí)聯(lián)反應(yīng)。
圖2. 乙?;揎椨绊憄hyA的穩(wěn)定性與生物學(xué)功能
(3)賴氨酸去乙?;窰DT2介導(dǎo)phyA的去乙?;?/strong>
通過蛋白質(zhì)復(fù)合體等互作實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),植物特有的賴氨酸去乙?;窰DT2在光照后與phyA在細(xì)胞核內(nèi)特異結(jié)合。生化分析顯示,照光后HDT2催化phyA的K65位點(diǎn)去乙酰化,促進(jìn)了其泛素化和蛋白降解。超表達(dá)HDT2促進(jìn)而突變HDT2抑制phyA的蛋白降解。遺傳證據(jù)進(jìn)一步表明,HDT2特異性參與了phyA介導(dǎo)的遠(yuǎn)紅光信號(hào)途徑。
綜上,研究團(tuán)隊(duì)揭示了HDT2-phyA調(diào)控模塊的核心分子機(jī)制:在黑暗條件下,phyA以高乙酰化狀態(tài)累積;幼苗出土照光后,phyA進(jìn)入細(xì)胞核被HDT2去乙?;?,進(jìn)而觸發(fā)泛素化修飾與26S蛋白酶體途徑降解。該級(jí)聯(lián)反應(yīng)精確調(diào)控了遠(yuǎn)紅光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與光形態(tài)建成。
值得關(guān)注是,團(tuán)隊(duì)近期在Plant Communications(2025)在線發(fā)表了“乙?;?磷酸化互作”調(diào)控向光素phot1激酶活性與植物向光性的研究成果。系列工作表明:乙?;ㄟ^協(xié)同泛素化、磷酸化等翻譯后修飾,構(gòu)成植物光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的多維調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
圖3. HDT2介導(dǎo)phyA去乙?;{(diào)控遠(yuǎn)紅光信號(hào)與光形態(tài)建成
3、研究團(tuán)隊(duì)
中國(guó)科學(xué)院華南植物園鄭楓助理研究員、碩士研究生歐文立與鄧玲為論文的共同第一作者,劉勛成研究員為通訊作者。博士研究生王雅寒與陳航聰,碩士研究生陳依婷、彭滔與楊泳儀,以及國(guó)際合作者Jaime A. Teixeira da Silva博士參與了該項(xiàng)研究工作。相關(guān)研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金與中國(guó)科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)優(yōu)秀會(huì)員項(xiàng)目資助。論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.08.002
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